Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIG2O94898 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG2O94898 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG2O94898 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms