Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTL6BO94805 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTL6BO94805 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTL6BO94805 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTL6BO94805 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTL6BO94805 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTL6BO94805 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTL6BO94805 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTL6BO94805 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTL6BO94805 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTL6BO94805 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTL6BO94805 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTL6BO94805 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms