Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BANF1O75531 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BANF1O75531 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BANF1O75531 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BANF1O75531 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BANF1O75531 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BANF1O75531 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BANF1O75531 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BANF1O75531 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BANF1O75531 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BANF1O75531 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BANF1O75531 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BANF1O75531 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BANF1O75531 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BANF1O75531 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BANF1O75531 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF1O75531 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF1O75531 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF1O75531 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF1O75531 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF1O75531 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF1O75531 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF1O75531 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF1O75531 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BANF1O75531 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF1O75531 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF1O75531 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF1O75531 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF1O75531 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF1O75531 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF1O75531 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF1O75531 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF1O75531 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF1O75531 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BANF1O75531 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BANF1O75531 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BANF1O75531 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BANF1O75531 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BANF1O75531 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BANF1O75531 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BANF1O75531 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BANF1O75531 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BANF1O75531 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BANF1O75531 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BANF1O75531 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BANF1O75531 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BANF1O75531 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BANF1O75531 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BANF1O75531 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BANF1O75531 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BANF1O75531 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BANF1O75531 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BANF1O75531 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BANF1O75531 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BANF1O75531 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BANF1O75531 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BANF1O75531 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BANF1O75531 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BANF1O75531 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BANF1O75531 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BANF1O75531 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BANF1O75531 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BANF1O75531 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BANF1O75531 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BANF1O75531 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BANF1O75531 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BANF1O75531 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms