Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM24O75264 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM24O75264 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM24O75264 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms