Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SORBS3O60504 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORBS3O60504 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SORBS3O60504 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms