Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MARCH6O60337 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms