Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA2O43921 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms