Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFSF14O43557 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF14O43557 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms