Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRXO43186 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRXO43186 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRXO43186 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRXO43186 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRXO43186 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRXO43186 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRXO43186 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRXO43186 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRXO43186 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRXO43186 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRXO43186 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRXO43186 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRXO43186 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms