Protein–RNA interactions for Protein: O43182

ARHGAP6, Rho GTPase-activating protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP6O43182 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP6O43182 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP6O43182 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms