Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNN4O15554 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNN4O15554 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.9 ms