Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FANCAO15360 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FANCAO15360 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
FANCAO15360 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
FANCAO15360 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
FANCAO15360 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FANCAO15360 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FANCAO15360 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FANCAO15360 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FANCAO15360 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
FANCAO15360 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
FANCAO15360 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FANCAO15360 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
FANCAO15360 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
FANCAO15360 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FANCAO15360 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FANCAO15360 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
FANCAO15360 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
FANCAO15360 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FANCAO15360 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FANCAO15360 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FANCAO15360 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FANCAO15360 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FANCAO15360 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FANCAO15360 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FANCAO15360 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FANCAO15360 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FANCAO15360 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FANCAO15360 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FANCAO15360 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
FANCAO15360 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
FANCAO15360 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
FANCAO15360 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FANCAO15360 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FANCAO15360 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FANCAO15360 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FANCAO15360 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FANCAO15360 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FANCAO15360 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCAO15360 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCAO15360 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCAO15360 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCAO15360 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCAO15360 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCAO15360 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCAO15360 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCAO15360 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCAO15360 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCAO15360 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FANCAO15360 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
FANCAO15360 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
FANCAO15360 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
FANCAO15360 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FANCAO15360 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FANCAO15360 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
FANCAO15360 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
FANCAO15360 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FANCAO15360 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FANCAO15360 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FANCAO15360 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FANCAO15360 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FANCAO15360 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FANCAO15360 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FANCAO15360 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCAO15360 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
FANCAO15360 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
FANCAO15360 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.21
FANCAO15360 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FANCAO15360 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms