Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM9SF1O15321 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF1O15321 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms