Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME4O00746 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME4O00746 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME4O00746 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME4O00746 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NME4O00746 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME4O00746 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME4O00746 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME4O00746 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME4O00746 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME4O00746 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME4O00746 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME4O00746 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME4O00746 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME4O00746 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME4O00746 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME4O00746 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME4O00746 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME4O00746 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME4O00746 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME4O00746 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NME4O00746 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME4O00746 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME4O00746 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME4O00746 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NME4O00746 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NME4O00746 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NME4O00746 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NME4O00746 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME4O00746 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME4O00746 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME4O00746 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME4O00746 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME4O00746 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME4O00746 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME4O00746 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME4O00746 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME4O00746 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NME4O00746 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NME4O00746 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NME4O00746 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME4O00746 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms