Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC7O00311 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC7O00311 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC7O00311 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC7O00311 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC7O00311 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC7O00311 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC7O00311 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC7O00311 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC7O00311 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC7O00311 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC7O00311 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC7O00311 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC7O00311 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC7O00311 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC7O00311 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC7O00311 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC7O00311 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC7O00311 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC7O00311 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC7O00311 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC7O00311 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC7O00311 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC7O00311 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC7O00311 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC7O00311 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC7O00311 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC7O00311 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC7O00311 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC7O00311 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC7O00311 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC7O00311 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC7O00311 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC7O00311 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC7O00311 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC7O00311 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC7O00311 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC7O00311 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC7O00311 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC7O00311 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC7O00311 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC7O00311 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC7O00311 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC7O00311 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC7O00311 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC7O00311 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC7O00311 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC7O00311 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC7O00311 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC7O00311 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC7O00311 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC7O00311 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms