Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGRPO00253 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGRPO00253 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGRPO00253 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGRPO00253 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGRPO00253 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGRPO00253 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGRPO00253 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGRPO00253 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGRPO00253 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGRPO00253 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGRPO00253 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGRPO00253 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGRPO00253 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGRPO00253 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGRPO00253 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGRPO00253 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGRPO00253 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGRPO00253 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGRPO00253 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGRPO00253 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AGRPO00253 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGRPO00253 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGRPO00253 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGRPO00253 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGRPO00253 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGRPO00253 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGRPO00253 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGRPO00253 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGRPO00253 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGRPO00253 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AGRPO00253 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGRPO00253 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGRPO00253 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGRPO00253 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGRPO00253 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGRPO00253 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGRPO00253 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGRPO00253 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGRPO00253 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGRPO00253 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGRPO00253 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGRPO00253 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGRPO00253 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGRPO00253 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGRPO00253 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGRPO00253 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGRPO00253 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGRPO00253 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGRPO00253 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGRPO00253 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGRPO00253 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGRPO00253 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGRPO00253 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGRPO00253 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGRPO00253 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGRPO00253 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGRPO00253 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGRPO00253 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGRPO00253 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGRPO00253 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms