Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC4-APOC2K7ER74 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms