Protein–RNA interactions for Protein: H3BRB1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRB1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BRB1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BRB1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BRB1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BRB1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BRB1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BRB1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BRB1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BRB1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BRB1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BRB1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BRB1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BRB1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BRB1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BRB1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BRB1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BRB1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BRB1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BRB1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BRB1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BRB1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BRB1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BRB1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BRB1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BRB1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BRB1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BRB1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BRB1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BRB1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BRB1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BRB1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BRB1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BRB1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BRB1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BRB1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BRB1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BRB1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BRB1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BRB1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BRB1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BRB1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BRB1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BRB1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BRB1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms