Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms