Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK3BL2E5RIL1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UPK3BL2E5RIL1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
UPK3BL2E5RIL1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UPK3BL2E5RIL1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK3BL2E5RIL1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK3BL2E5RIL1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK3BL2E5RIL1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms