Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HHLA1C9JL84 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HHLA1C9JL84 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms