Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM233B4DJY2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM233B4DJY2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM233B4DJY2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms