Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM1B2RUZ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms