Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NNZ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNZ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNZ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNZ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNZ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNZ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNZ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNZ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNZ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NNZ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NNZ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NNZ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NNZ2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NNZ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A6NNZ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A6NNZ2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A6NNZ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A6NNZ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A6NNZ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNZ2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNZ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNZ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNZ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNZ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNZ2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNZ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNZ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NNZ2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A6NNZ2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
A6NNZ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A6NNZ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NNZ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NNZ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NNZ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NNZ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NNZ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NNZ2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NNZ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NNZ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NNZ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NNZ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NNZ2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NNZ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NNZ2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NNZ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NNZ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NNZ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NNZ2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NNZ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NNZ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NNZ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NNZ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NNZ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NNZ2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNZ2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNZ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNZ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNZ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNZ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNZ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNZ2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNZ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNZ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NNZ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNZ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNZ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNZ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNZ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNZ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNZ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNZ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNZ2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NNZ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NNZ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A6NNZ2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms