Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VWA3AA6NCI4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA3AA6NCI4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms