Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSDA5PKW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PSDA5PKW4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms