Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTAGE9A4FU28 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTAGE9A4FU28 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTAGE9A4FU28 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms