Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC78A2IDD5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC78A2IDD5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms