Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIPSLA2A3N6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIPSLA2A3N6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms