Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC189A1A4V9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC189A1A4V9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC189A1A4V9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms