Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAARA0A1B0GVQ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms