Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GTW7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTW7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms