Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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