Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6M4

CSNK1G3, Casein kinase I isoform gamma-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3Q9Y6M4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CSNK1G3Q9Y6M4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CSNK1G3Q9Y6M4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CSNK1G3Q9Y6M4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CSNK1G3Q9Y6M4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CSNK1G3Q9Y6M4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1G3Q9Y6M4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CSNK1G3Q9Y6M4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CSNK1G3Q9Y6M4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CSNK1G3Q9Y6M4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CSNK1G3Q9Y6M4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1G3Q9Y6M4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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