Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms