Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms