Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms