Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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USP35Q9P2H5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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USP35Q9P2H5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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USP35Q9P2H5 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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USP35Q9P2H5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP35Q9P2H5 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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