Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM248Q9NWD8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms