Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms