Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms