Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXNA4Q9HCM2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms