Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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