Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms