Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDAC8Q9BY41 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDAC8Q9BY41 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDAC8Q9BY41 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDAC8Q9BY41 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDAC8Q9BY41 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDAC8Q9BY41 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HDAC8Q9BY41 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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