Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms