Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms