Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms