Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms