Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms